Hallo thomasd,
Momentan hast du ein "shadowing" Problem, welches auftritt, wenn 2 Dateien nach der Dateinamen-Entschlüsselung (also das was du im Boxcryptor Laufwerk siehst) den selben Namen und den selben Dateipfad haben.
Vermutlich wurde der Ordner bzw die Datei einmal von dir selbst verschlüsselt angelegt, und einmal von deinem Programm unverschlüsselt. Um das zu beheben solltest du den unverschlüsselten Order / die Datei am besten direkt in OneDrive löschen, somit wird der verschlüsselte Ordner / die Datei wieder sichtbar und die Fehlermeldung verschwindet.
Um ganz sicher zu gehen, dass dein Programm Dateien und Ordner verschlüsselt anlegt, erstelle einen verschlüsselten Ordner im Boxcryptor Laufwerk und lass das Programm INNERHALB dessen seine Ordner und Dateien anlegen.
Viele Grüße,
Florian