Hi bc2bs,
Boxcryptor verfolgt eine Hierarchische Verschlüsselungs-Strategie: Wird ein Ordner verschlüsselt, werden auch zukünftig alle seine "Kinder" automatisch verschlüsselt. Nur auf der Top-Level Ebene einer Location und in unverschlüsselten Ordnern werden Dateien nicht automatisch verschlüsselt, hier wird, falls über den Explorer/Finder gearbeitet wird, ein Dialogfenster aufgemacht, wo gefragt wird, ob die entsprechende Datei verschlüsselt werden soll.
Zu deinen weiteren Fragen:
Boxcryptor verhält sich für andere Programme wie ein ganz normales Laufwerk.
Intern werden Dateizugriffe in beide Richtungen im Arbeitsspeicher gecached und bei Bedarf werden Ver- und Entschlüsselungstechniken angewandt. Programme halten Benutzerdaten meist im RAM und legen sie erst beim Speichern zurück auf der Festplatte ab. Über das Boxcryptor Laufwerk passiert nun ähnliches, die Dateien werden zurück an das Laufwerk gegeben und dieser Datenstrom wird ggf. verschlüsselt wieder an die eigentliche Festplatte weitergereicht.
Genaueres kannst du unter: https://www.eldos.com/cbfs/spec.php#product nachlesen, das ist das Boxcryptor zugrunde liegende virtuelle Dateisystem.
Viele Grüße,
Florian
